Som statlig myndighet lyder Läkemedelsverket under Socialdepartementet. Från och med den 1 juli 2018 har Läkemedelsverket en myndighetsledning i form av en styrelse som utses av regeringen.
Ordförande: Nils Gunnar Billinger, tidigare generaldirektör, Luftfartsstyrelsen, Post- och telestyrelsen och fd statssekreterare
Emma Spak, läkare och samordnare för nära vård, Sveriges Kommuner och Landsting
Björn Eriksson, förvaltningschef, Skånes universitetssjukhus
Per Johansson, myndighetschef, Revisorsinspektionen
Catarina Andersson Forsman, generaldirektör, Läkemedelsverket