Som statlig myndighet lyder Läkemedelsverket under Socialdepartementet. Från och med den 1 juli 2018 har Läkemedelsverket en myndighetsledning i form av en styrelse som utses av regeringen.
Ordförande: Nils Gunnar Billinger, tidigare generaldirektör, Luftfartsstyrelsen, Post- och telestyrelsen och fd statssekreterare
Emma Spak, läkare och samordnare för nära vård, Sveriges Kommuner och Landsting
Björn Eriksson, hälso- och sjukvårdsdirektör, Region Stockholm
Per Johansson, myndighetschef, Revisorsinspektionen
Catarina Andersson Forsman, generaldirektör, Läkemedelsverket